تتاح خدمة النقل بالحافلات للطلاب مقابل رسوم إضافية ، ويوجد لكل حافلة مشرف مهمته تنظيم السلوك وضمان سلامة الطلاب في الحافلة ، و في حدوث أي تغيير في مواعيد الانتقال بالحافلة يجب إبلاغ المدرسة مسبقا . موعد مغادرة الحافلات من المدرسة هو الساعة 3:20 عصرا وعلى الطلاب الالتزام بذلك الموعد .

قواعد السلوك في الحافلة:

•  يعتبر طلاب مدرسة مصر الحديثة  ممثلين لها ، ويجب عليهم احترام القواعد والتصرف بشكل ملائم ، وذلك عن طريق التزام كل طالب بمقعده في الحافلة فور صعوده لها وعدم التحرك من مكانه حرصا على سلامته ، وعدم وقوفه أوتغييره  مقعده أثناء تحرك الحافلة  تحت أي ظرف .
• لا يسمح بتناول الطعام والشراب أوالتدخين داخل الحافلة .
• يجب على الطلاب خفض أصواتهم والتحدث باحترام مع بعضهم البعض داخل الحافلة ، ويجب على الطلاب الكبار أن يساعدوا زملاءهم الصغار في المحافظة على النظام.
• يجب التأكد من وقوف الحافلة تماما قبل فتح الأبواب.

جزاءات متعلقة بالحافلة المدرسية:

المستوى الأول (تعديات محدودة ):

سلوك غير لائق يؤدي إلى تشتيت تركيز السائق أو إيذاء أي من الزملاء ، ويتضمن ذلك السلوكيات الآتية :

• استخدام الصوت العالي
• التحرك في الحافلة
• محاولة دفع أحد الطلاب أو مضايقته أو ضربه
• عدم احترام السائق أو أي من الطلاب
• التأخر المتكرر عن الحافلة
• عدم اتباع أي من أوامر السائق
• التحدث بالألفاظ النابية
• حيازة أدوات الإشعال مثل: الكبريت و القداحة (الولاعة)
• تناول الأطعمة والمشروبات في الحافلة
• العبث بمطفأة الحرائق أو الأبواب
• إلقاء أي شيء من نافذة الحافلة

المستوى الثانى (تعديات بالغة ):

• وتطبق في حالة حدوث سلوكيات عنيفة تؤدي إلى ضررالطلاب أو السائق أو العامة بطريقة مباشرة أو غير مباشرة مثل :
• تكرار الأفعال التي تستوجب جزاءات بسيطة  خمس مرات فأكثر
• التهديد باستخدام العنف مع السائق أو أحد موظفي المدرسة
• استخدام الألفاظ النابية مع السائق
• استخدام أدوات الإشعال مثل : الكبريت و القداحة (الولاعة )
• حيازة  الألعاب النارية
• التشاجر داخل الحافلة
• حيازة  أسلحة
• تخريب أى من محتويات الحافلة
• السرقة

نتيجة التعدي على قوانين الحافلة